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腫瘤免疫檢查點TIM-3作用新發(fā)現(xiàn)!
2021.11.15
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一、導言


小編今天給大家分享一篇2021年5月發(fā)表于Nature的關(guān)于腫瘤免疫治療的文章——TIM-3 restrains anti-tumour immunity by regulating inflammasome activation.腫瘤免疫治療是現(xiàn)在乃至未來研究的一個大熱點,而T細胞免疫球蛋白粘蛋白3(TIM-3)是繼PD-1/PD-L1和CTLA-4之后,又一個新興的免疫檢查點分子。TIM-3在腫瘤微環(huán)境中CD8+?T細胞上的表達被認為是T細胞功能障礙的主要標志,然而,TIM-3也在其他幾種類型的免疫細胞上表達,那么T細胞之外的免疫細胞很有可能參與抗腫瘤作用。在這里,研究者采用敲除TIM-3和單細胞RNA測序證明了TIM-3對樹突狀細胞(DCs)的重要性,即DCs上TIM-3的缺失——而不是CD4+或CD8+?T細胞,促進更強大的抗腫瘤免疫作用。TIM-3的缺失使DCs無法表達調(diào)節(jié)程序,并促進了CD8+效應和干細胞樣T細胞的維持。此外,DCs中TIM-3的缺失導致活性氧簇的積累增加,從而導致NLRP3的激活。抑制惡性腫瘤組織激活或下游表達的細胞因子IL-1β和IL-18,完全消除了DCs中TIM-3缺失所觀察到的保護性抗腫瘤免疫。研究者揭示了TIM-3在調(diào)節(jié)DC功能中的重要作用,并強調(diào)了阻斷TIM-3通過調(diào)節(jié)炎癥小體的激活來促進抗腫瘤免疫的潛力。


二、結(jié)果展示


1、樹突狀細胞上缺失TIM-3可以減少腫瘤負擔


為了探究TIM-3在T細胞中的功能,研究者制備了條件性敲除小鼠,敲除 CD4+和CD8+?T細胞、CD8+?T細胞或調(diào)節(jié)性T(Treg)細胞中的TIM-3。結(jié)果發(fā)現(xiàn),CD4+和CD8+?T細胞的缺失可適度減少免疫原性MC38結(jié)腸癌的腫瘤負擔,而CD8+?T細胞或Treg細胞的缺失則沒有影響。TIM-3在自然殺傷細胞(NK)上也有表達,但是,使用Ncr1cre特異性缺失對腫瘤生長沒有影響。這些意外的發(fā)現(xiàn),使研究者認為TIM-3在調(diào)節(jié)抗腫瘤免疫中的作用,可能主要是通過髓系細胞,特別是DCs介導的,其TIM-3在體內(nèi)高表達。最近,通過對人類疾病的觀察,髓系細胞中TIM-3表達的重要性變得明顯,編碼TIM-3的Havcr2基因的突變,與髓系細胞的過度激活和IL-18水平的升高有關(guān)。

?為了全面探究TIM-3的表達譜,研究者對腫瘤浸潤CD45+細胞(腫瘤浸潤淋巴細胞(TILs))進行了單細胞RNA測序分析(scRNA-seq),并對野生型 MC38-OVAdim腫瘤小鼠引流和非引流淋巴結(jié)中的CD45+細胞進行測序比較。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在淋巴組織中,Havcr2的表達在表達經(jīng)典DC1標志物Xcr1和Clec9a的一簇細胞中最為突出。然而,在腫瘤中,Havcr2表達于多種細胞類型,包括DCs、CD8+?T細胞、Treg細胞、單核細胞和巨噬細胞。使用Cd11ccre敲除DCs中的TIM-3,觀察到腫瘤生長顯著減少。進一步用 KP1.9肺腺癌細胞株進行驗證,發(fā)現(xiàn)Havcr2cko小鼠腫瘤負擔顯著減少。DC-transfer實驗也證明了樹突狀細胞內(nèi)在的 TIM-3的缺失足以促進抗腫瘤免疫。研究者還比較了臨床上樹突狀細胞和T細胞上TIM-3的缺失情況,發(fā)現(xiàn)DC人群中TIM-3的缺失導致更好的腫瘤生長抑制。


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2、TIM-3缺失的DCs擴增干細胞樣CD8+T細胞

利用scRNA-seq,研究者分析了Havcr2fl/fl和Havcr2cko小鼠中攜帶 MC38-OVAdim?腫瘤的TILs,鑒定了15種不同的細胞類型,包括4個淋巴樣細胞群,1個NK細胞群,7個不同的髓樣細胞群和3個cDC群。在Havcr2fl/fl和Havcr2cko小鼠的樣本中,所有的簇都有表達,但是比例不同。特別是集群0(包含單核細胞衍生的巨噬細胞)、集群10和12(包含活化的B細胞)和集群7(包含CD8+T細胞)在Havcr2cko小鼠的腫瘤中表現(xiàn)更為突出。

?通過分析CD8+T細胞(集群7),觀察到Havcr2cko小鼠的腫瘤細胞表達更高水平的基因特征,這些基因特征存在于一系列功能狀態(tài)中,包括早期激活、效應、記憶和記憶前體。研究者假設樹突狀細胞缺失TIM-3可能有助于誘導或維持干細胞樣CD8+T細胞,觀察到Havcr2cko小鼠的腫瘤中PD-1單陽性TILs 的頻率和絕對數(shù)量顯著增加可支持這一觀點。PD-1+?TILs已被證明是包含干細胞樣和效應樣CD8+TILs。因此,研究者評估了細胞表面標記物的表達,區(qū)分這兩個種群。研究發(fā)現(xiàn),在Havcr2cko小鼠中浸潤腫瘤的PD-1+?CD8+T細胞上IL-7R、CD5和CXCR5的表達增加,表明干細胞樣CD8+TILs數(shù)量增加。與這些結(jié)果相一致,在Havcr2cko小鼠的腫瘤中觀察到CXCR5+?TIM-3CD8+T細胞的顯著擴增,以及TCF1(記憶前體T細胞的特征)。研究者進一步發(fā)現(xiàn)CX3CR1、T-bet和ki67的表達增加,表明進入效應譜系的細胞數(shù)量增加。這些結(jié)果表明,DCs上TIM-3表達的缺失促進了干細胞樣CD8+T細胞和效應T細胞的維持,共同促進了Havcr2cko小鼠腫瘤的保護性免疫應答。


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3、TIM-3缺失增強抗原特異性免疫

通過對單細胞數(shù)據(jù)集中的髓系細胞進行亞群分析,發(fā)現(xiàn)10個不同轉(zhuǎn)錄的亞群,這些亞群在Havcr2fl/flHavcr2cko小鼠的腫瘤中都有表達,但比例不同。特別是集群0(CCR5表達單核細胞衍生的巨噬細胞)在Havcr2cko小鼠的腫瘤中富集。相反,在集群9(嗜中性粒細胞)、集群6(DC1s)和集群8(migDCs)中的比例較小。

?migDC群已經(jīng)被證明在腫瘤微環(huán)境中獲得調(diào)節(jié)程序,導致成熟的樹突狀細胞富含免疫調(diào)節(jié)分子(mregDCs),抑制了這些細胞的免疫原性潛力。在髓細胞上得到這個特征確實突出了簇8,migDCs在Havcr2cko小鼠中的評分較低,伴隨著免疫調(diào)節(jié)分子在 mregDCs中的表達減少,包括IL-4R、CD200、CD83和OX-40。研究者進一步探究IL-4阻斷劑對Havcr2cko荷瘤小鼠的影響。結(jié)果發(fā)現(xiàn),抗IL-4治療可明顯延緩Havcr2fl/fl小鼠的腫瘤生長,但對Havcr2cko小鼠無效。這說明 TIM-3的缺失可能會阻礙mcreDC程序的獲得,使migDCs能夠獲得完整的免疫原性程序。通過對髓樣細胞群進行評分,發(fā)現(xiàn)Havcr2cko集群8 migDCs有明顯富集,其中與MHC I類主要組織相容性復合體相關(guān)的幾個基因,包括Wdfy4、Cybb、 Tapbpl和H2-M2被上調(diào)。體外細胞實驗發(fā)現(xiàn),Havcr2cko小鼠腫瘤中抗原特異性CD8+T細胞的頻率增加,產(chǎn)生更高水平的效應細胞因子IFN-γ、TNF和IL-2,具有更大的細胞毒性潛能,增加顆粒B、CD107α和穿孔素的表達,導致體內(nèi)CD8+T細胞溶解活性的增強。


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4、缺失TIM-3促進炎癥激活


通過進一步的生物信息學分析和細胞因子分析顯示,Havcr2fl/fl和Havcr2cko?小鼠的腫瘤組織中IL-1β和IL-18表達水平較高。IL-1β和IL-18都是緊密調(diào)節(jié)的細胞因子,在炎癥介導的過程中作為成熟蛋白釋放。通過對Havcr2fl/fl和Havcr2cko小鼠炎性基因差異表達的研究,發(fā)現(xiàn)Havcr2cko?migDCs的炎性基因明顯富集,包括涉及炎性基因激活的上游(Aim2和Nlrp3)和下游(Casp1、Casp4和IL18)接頭分子。?


研究者假設,內(nèi)源性損傷相關(guān)的分子模式,包括活性氧類、氧化脂質(zhì)和氧化 DNA,可能在腫瘤浸潤的Havcr2cko?DCs 中引起炎癥組激活。事實上,Havcr2cko?migDCs在與氧化應激相關(guān)的基因特征上得分更高,其關(guān)鍵酶SOD1、SOD2、BAG3和PRDX5的表達上調(diào)。另外檢測了MC38-OVAdim腫瘤的DCs的活性氧類活性,發(fā)現(xiàn)Havcr2cko?DC1s和migDCs的活性顯著增加。此外,抗氧化劑N-乙酰半胱氨酸可以完全逆轉(zhuǎn)對Havcr2cko小鼠腫瘤生長的保護性抑制。減少 Havcr2cko小鼠腫瘤中的氧化應激也能完全消除IL-1β的分泌。?


最后,研究者采用3種不同的方法在體內(nèi)靶向炎癥途徑:(1)caspase 1抑制劑干擾 pro-IL-1β和pro-IL-18分裂;(2)MCC950干擾炎癥小體復合蛋白ASC寡聚化;(3)抗IL-1β和抗IL-18阻斷抗體(anti-IL-1β/IL-18)抑制下游細胞因子。每種方法都可以消除Havcr2cko的保護性抗腫瘤免疫作用,其中anti-IL-1β/ IL-18的效果最強。此外,流式細胞術(shù)分析治療的Havcr2cko小鼠腫瘤顯示完全逆轉(zhuǎn)的CD8+表型。值得注意的是TIM-3被證明是通過與TIR8相互作用,負向調(diào)節(jié)IL-1β和IL-18受體信號。這種相互作用在DCs中是如何發(fā)揮作用的,目前尚不清楚,但可能牽涉到一種自分泌前饋環(huán)路。在這種環(huán)路中,缺失DCs上的TIM-3會導致IL-1β的生成,同時增強IL-1β的反應,共同促進免疫原性DCs的產(chǎn)生。


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三、總結(jié)


TIM-3已經(jīng)成為一個極具吸引力的治療靶點,新出現(xiàn)的數(shù)據(jù)表明,在AML和骨髓增生異常綜合征中,TIM-3的阻斷會誘發(fā)50-60%的應答率,這表明TIM-3的阻斷可以作為髓系腫瘤的治療策略,而其他檢查點抑制劑的治療效果則有限。該文章證明了TIM-3的缺失,阻礙migDCs 獲得調(diào)節(jié)程序,促進由IL-1β和IL-18驅(qū)動的CD8+T細胞效應的維持。這些結(jié)果進一步證明了通過刺激炎癥通路治療癌癥的可行性,并強調(diào)了阻斷TIM-3在釋放炎癥通路以增強抗腫瘤免疫力方面的價值。


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